2005年2月17日，国家教育部正式批准在万州卫生学校和万县中医药学校合并基础上建立重庆三峡医药高等专科学校。重庆三峡医药高等专科学校系专科层次的普通高等学校，实行重庆市与万州区人民政府共建、以万州区为主的管理体制。学校全日制在校生规模暂定为6000人。